當奈米晶片啟動時，它將強化你的部隊的戰鬥屬性。奈米晶片有八種不同的類型，每一種都能提高某些類別的部隊的某一特徵。您選擇哪種奈米晶片取決於您想強化哪種類型的部隊。
若要管理你的奈米晶片，你將需要升級奈米科技實驗室。您的奈米科技實驗室的等級越高，你可以結合並啟動的奈米晶片的等級也就越高。
該建築有幾個槽位可供存儲奈米晶片——這些可在介面的底部找到。在頂部也有特別的奈米晶片槽位，那裡的奈米晶片都已被啟動。在遊戲開始時，只有一個奈米晶片啟動槽位是開啟的。您將需要奈米晶片槽位解鎖器以便解鎖新的槽位。奈米晶片槽位解鎖器可從商店獲得，但也會在您每日簽到的第15和32天免費提供給你。
如果您想要在一個已被佔用的槽位中啟動奈米晶片，您將需要先提取出當前處於活動狀態的奈米晶片。奈米晶片可以用奈米晶片提取器物品來安全移除。如果你不使用提取器，奈米晶片將被銷毀。
可以在等級1至4的奈米晶片上使用的提取器是免費的。其他的則需要從商店獲得。所有提取器都只能單次使用。
你可以在您的奈米科技實驗室中的「結合」選項卡中，結合你的奈米晶片，讓他們獲得升級且變得更強大。要這麼做，您需要兩個相同等級的奈米晶片，并在您的存儲槽位中點擊所需的奈米晶片，然後點擊「結合」。升級您的奈米科技實驗室將允許您結合更高等級的奈米晶片，最高可達12級。
奈米晶片可在奈米包中找到。這些物品可透過以下方式獲得：
- 作為參加比賽的獎勵
- 作為完成特別行動的懸賞
- 在商店中使用鑽石換取
- 透過完成某些資源配給任務
- 作為每日簽到的某些天的獎勵