暗黑基地是地圖上的特殊位置。它們特別重要，因為它們是血清的來源。如果聯盟控制了暗黑基地，意味著他們不僅控制了血清，還控制了地圖上的領土。這會轉化為優勢點，並計入他們在聯盟排名中的整體位置。
你必須先捕獲一個暗黑基地，才能對其進行控制。不過，一旦捕獲，你的暗黑基地會成為其他聯盟和鳳凰集團的目標，他們會用武力奪取對暗黑基地的控制權。為此，你有必要在你控制的任何暗黑基地駐守強大的防禦部隊。
你可以從你的聯盟中心查看你的聯盟控制的暗黑基地。一旦你選擇了一個暗黑基地，你將看到以下選項卡：
- 資訊。此選項卡顯示暗黑基地的一般資訊，並允許你升級節點。
- 駐軍。這裡顯示所有駐紮在暗黑基地的部隊。
- 強化。此選項卡允許你利用血清來強化部隊。
- 傳送血清。此選項卡用於管理血清的傳送。
- 歷史。此選項卡顯示暗黑基地中的所有血清和資源轉移的詳情。