연합의 원수는 연합 본부를 건설할 수 있습니다. 연합 본부를 통해 부대원을 더욱 강력하게 성장시키고 연합원들을 쉽게 통솔할 수 있습니다.
연합 본부는 총 21레벨로 이루어져 있습니다(0~20레벨). 건설 직후의 연합 본부는 3 레벨로 시작하지만, 적군 연합의 공격으로 인해 0레벨까지 약화될 수 있습니다. 연합 본부의 레벨이 올라갈수록 받을 수 있는 특혜가 많아집니다.
연합 본부의 레벨이 올라갈 때마다 추가로 보너스 점령 포인트 및 점령 보너스를 획득할 수 있으며, 연합 기술을 통해 받을 수 있는 보너스도 증가합니다.
정식 연합원(훈련소에 속해있는 훈련병 제외)들만 연합 본부에 방문할 수 있습니다.